《红树林》杂志创刊于1993年1月。由深圳红树林杂志社出版发行。当时为大16开开本，半彩半单，32页。

1994年11期开始，拥有全国刊号。1996年，《红树林》版面有较大调整，开本由大16开改为正16开，页面增至48页，半彩半双色。同年发行量也有较大增长，由原来的月发行2.5万增长至8万。1999年，月发行量更增至10万份，发行地区突破了深圳本地局限，辐射珠三角乃至全国。2002年起，改为全部彩色排版。2003年9月起，《红树林》出版上下半月刊，上半月刊名《红树林·都市少儿》，下半月刊名《红树林·芝麻开门》。目前两刊合计月发行25万份。